各位可以加入史丹佛大學蛋白質研究計劃Folding@Home幫助解開眾多疾病之謎



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天氣預報
2006-09-10, 12:45 AM
各位可以加入史丹佛大學蛋白質研究計劃Folding@Home幫助解開眾多疾病之謎

Folding@Home 是由史丹佛大學所主導的蛋白質摺疊研究計劃,透過電腦運算的模擬來研究蛋白質折疊,誤折,聚合及由此引起的阿茲海默症、狂牛病、帕金森氏症...等相關疾病的成因與治療方法。

以上來自巴哈姆特新聞
http://gnn.gamer.com.tw/5/24455.html

軟體下載
http://folding.stanford.edu/download.html

好像有以Taiwan為單位的組織
加入時記得選取
也可以多轉貼喔

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天氣預報
2006-09-10, 09:21 PM
在巴哈姆特看到的

本文原作者:swfily

大家來幫忙藥物的研究 幫台灣加油吧---folding@home

很多新藥與疾病的研究都在於我們不了解蛋白質的"構型"(也就是蛋白質的長相)
可是要了解蛋白質的構型就算靠超級電腦來做運算 也是很費時費力的工作
史丹福大學的研究室使用了分散式運算--集合眾多的小電腦就可以勝過超級電腦
來讓科學家早日解開蛋白質的秘密 以製作新藥與醫學研究來造福世界

這項軟體是利用CPU"多餘"的力量去做運算 所以不用擔心吃資源導致系統變慢
在平常的時候 CPU的使用率是不會到滿檔的 閒置時的使用率大約0-20%之間
那這套軟體就會利用剩下的80%去做運算
此軟體會依你目前正使用的軟體為優先 再彈性調整本身的使用率
也就是如果你的電腦很閒 CPU跑folding@home(簡稱FAH)的比例就會偏高
如果你的電腦很忙(例如玩遊戲) CPU跑FAH的比例就會偏低
當然我們可以自定CPU的使用程度
以我為例 我自己是設定在CPU使用率為95%附近
有時候玩玩遊戲也不會刻意去關掉
ㄧ邊轉APE檔一邊跑也沒有任何問題

根據此段文章所述
http://folding.stanford.edu/faq.html#project.own
研究的成果將會公開發表在期刊且供所有人使用

這裡有相關的下載
http://folding.stanford.edu/download.html

這是研究首頁
http://folding.stanford.edu/
看名稱就知道是哪間學校的嚕

據說目前台灣積分最高的團隊是編號 31403 的團隊(這是我上網找的結果啦)
反正這是一份利人利己的工作 希望大家一起來幫台灣加油呀

我也是XP的 我是選第一項啦 底下直接給連結好嚕
http://www.stanford.edu/group/pandegroup/release/[email protected]

其實我是之前在巴哈看到PS3也有支援 才知道這項計畫的
暨以前intel主持的人類基因體計畫之後 現在又有個解蛋白質folding的計畫..
越多人幫忙 也可以一起提升台灣的研究水準
不過反正越快獲得蛋白質的相關資訊 搞不好可以立刻用在我們身上呢~~

附帶一題 安裝軟體的時候 它會要你輸入名字
這個名字有點類似帳號 隨便取一取就可以了 不過要先確認有沒有重複
以下網址可以確認
http://folding.stanford.edu/download.html

軟體安裝好之後 可以輸入你希望加入的運算團隊
如果忘記輸入也沒關係 等到軟體一切安裝就緒開始運作之後也可以更改
在右下角的FAH圖示按右鍵 選擇 configure

1.第一頁叫 User
username 之中還是可以自己改名(否則會使用安裝軟體時候所輸入的名字)
Team number 可以打你希望加入的團隊

2.第二頁叫Connection
也就是設定網路相關 看看有沒有在防火牆之後
不過我在公司使用內部區網也可以順利下載資料就是
如果有人發生問題 不妨po上來一起討論看看嚕

3.第三頁叫Display
A----protein(蛋白質):也就是蛋白質圖形的顯像選項
a-1.最上面的 Molecule Draw Rate(分子繪圖速率)是螢幕顯示計算分子的速度
想讓他跑快點就往右邊選 跑慢點就往左邊移 不過好像感覺沒差 =.=
a-2.Visualization type(表現模式):分子以哪一種方式呈現
random:隨機以球型或者骨架型來呈現
spacefill:分子以球型方式呈現
Ball & Stick:分子以骨架形式呈現
*不過不管怎麼選 自己覺得開心漂亮就好 對於實際運算好像沒影響*
B-----Screensaver(螢幕保護模式)
b-1.閒置__分鐘後開啟螢幕保護模式(預設不啟用)
b-2.只有在螢幕保護模式之下才啟用FAH(預設是關閉而且得在b-1開啟後才能選)
C-----Title(FAH畫面中的標題)
c-1.顯示標題(預設是開啟)
c-2.你可以隨便輸入你想放在FAH 的標題(我是懶得改嚕)
D-----Logos(標誌)
看起來似乎可以讓你放你想要的標誌 不過我對此興趣缺缺就沒選過了
大家可以玩玩後分享心得 ^^

4.第四頁叫 Advanced(進階選項)

Core Priority(FAH的執行順序)
A.Lowest possible(最低優先順序)--預設
B.Slightly higher(稍高一點的優先順序)
*一般選擇A就可以了 選B的話就變成一般的程式 會跟你常用的程式搶資源喔

CPU Usage Percent(調整CPU的使用率)
也就是讓你的CPU保持在你所調整的使用率上
我是放在大約95%的位置 不過看大家的情況 可以自由調整
Disable highly optimized assembly code(取消高效率模組)--預設關閉
如果系統不穩定 或者某些特殊的情況下可以考慮勾選
不過如果安裝FAH之後導致系統不穩 大家應該都會直接移除了吧 ^^
Checkpointing frequency(運算結果儲存頻率)
FAH會在運算一段時間後自動儲存結果
看你是要設定每3分鐘就儲存一次 還是要30分鐘才儲存一次
如此重開機之後就可以從上次的結果繼續運算下去
Power(電源)
使用電池時暫停工作(這是給NB使用以節省電源的)預設關閉
Deadlines(運算時限)
每筆資料如果再運算的時程終止時還沒有回傳資料給FAH 資料庫
則FAH 會把相同的運算再丟給另一台電腦去計算
(一方面增加運算效率 再來是它怕你不繼續參加運算 就把資料交給其他電腦繼續努力了)
預設是關閉 不過不管這個應該也沒關係 ^^

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以上是我自己做的小小翻譯 如果大家有想更正的就請回文吧 ^^
包含本文都可以讓大家自由轉貼 版權沒有 翻印不究
轉貼可以不附名字 目的就是希望大家可以一起加加油 ^^

本文原作者:swfily

skykent
2008-09-02, 08:36 AM
可以加入Folding@Home滄者極限團隊

團隊編號 133977

Folding@Home專屬討論區,教學資料豐富

http://forum.coolaler.com/forumdisplay.php?f=295

你可以模擬蛋白質摺疊,從根本解決人類疾病的問題

為世界醫學盡一份力

就從加入Folding@home滄者極限團隊開始

carloschen
2008-09-02, 10:21 AM
以前加入過UD Agent (http://www.grid.org/)和Boinc Synergy (http://www.boincsynergy.com/),跑了5~6年就移除了。癌症特效藥有出現嗎?有發現外星人了嗎?如果沒有,大家還要計算多久才會出現?
可能等大家的CPU都上10G加速計算,也許就有點發現吧。

Raziel
2008-09-19, 01:18 AM
目前所有台灣隊伍中,PCDVD的單隊產分已超過所有其他隊伍的總和,是為第一強隊.

隊名 : Folding@PCDVD@Taiwan
team ID:69220

我們是以高效顯示卡作為運算器的隊伍,三個月的時間已經衝進世界200強.
這是從UD, Seti@Home, WCG.....各專案以來前所未有的驚人成績.

我們也是目前唯一有系統在贊助與出借高效能顯示卡給隊友的團隊.:D

對於想要加入的朋友,選擇最強的隊伍,最精銳的部隊,以經驗及配備協助您

這是其他地方找不到的,目前已經有11位隊友無償的取得8800GT 512負責跑分,

九月底更有10張8800GT 512只以1500的價格贊助新隊員, 以兼顧節能減碳

的理念,追求最大的"每瓦運算力"的實際貢獻,並讓隊員可獲得升級的優惠.

參與領軍台灣區的第一強隊,相信是您最好的選擇.

歡迎有空 造訪我們的集中討論串 , 邀請您 改變觀念 伸出援手 就從今天開始吧.
http://www.pcdvd.com.tw/showthread.php?t=801136

ellery
2008-09-19, 12:08 PM
不懂, 為什麼與顯卡有關係?
一定要開著它的畫面才能跑嗎?

u8526425
2008-09-19, 01:09 PM
目前的顯卡除了3D加速之外
還能做物理加速與這方面的運算補助
GPU在這方面的運算能力還遠遠大於X86的CPU

Raziel
2008-09-19, 03:53 PM
不懂, 為什麼與顯卡有關係?
一定要開著它的畫面才能跑嗎?
簡單說,目前的技術,顯示卡也可以當作運算器來使用.
該程式的畫面不需要開著,只要讓它在背景默默的利用閒置的資源就行了.

為節能減碳,我們只需要您捐贈"零碎的GPU閒置時間", 哪什麼是閒置時間呢 ?

ex1:當您開啟一個網頁, 花了12秒看完一篇新聞或是討論, 這12秒就是一小段零碎電腦閒置的時間.

ex2:當你在版上要回一篇文, 打了兩分鐘的字, 電腦的使用率其實仍很低, 這也是一種零碎閒置時間.

ex3:當您在用電腦,忽然手機響了, 暫時離開電腦花了20秒講了一個電話,這20秒也是一小段零碎時間.

ex4:當您離開電腦去吃飯抽菸上廁所,設定五分鐘後待命, 在電腦進入待命前的這五分鐘,也是一段零碎時間.

ex5:反過來說,當你的電腦需要瘋狂轉檔時,會用盡系統資源,運算程式就自動暫停.

在完全不使用電腦的時候,希望您關機節能, 只有在要使用電腦的時候, 讓F@H程式利用零碎的時間來運算.

Raziel
2008-09-19, 04:33 PM
以前加入過UD Agent (http://www.grid.org/)和Boinc Synergy (http://www.boincsynergy.com/),跑了5~6年就移除了。癌症特效藥有出現嗎?有發現外星人了嗎?如果沒有,大家還要計算多久才會出現?
可能等大家的CPU都上10G加速計算,也許就有點發現吧。

我了解您的無奈.
F@H在歷史過程中,也已經發現與發表諸多成果,絕不是一場美麗的錯誤.
官網的得獎紀錄與成果發表:
http://folding.stanford.edu/English/Awards

不過,您說中了一部份,目前以合適的GPU來運算,的確是有百倍於CPU的實力.
也就是"每瓦輸出的運算力",有傳統CPU數十倍的經濟效益!!
這也是為什麼Folding@Home專案在今年七月後立即大放異彩的原因.
以新型的顯卡為運算工具,一躍成為最大運算力輸出的單一分散式專案.
目前起跑才三個月,歷史以來從沒有這麼容易能在全球排行中大步前進.
現在加入F@H, 選擇正確的運算工具與團隊,絕對是少有的契機.

加入Folding@Home團隊,分享你的閒置運算力,協助解決複雜的科學,疾病,與醫療等重要難題. (http://www.pcdvd.com.tw/showthread.php?t=801136)
九月份免費火力支援PCDVD F@H 團員13張8800GT剩餘卡數 : 1
(其餘累計: 11服役中,1洽談中)
火力支援第二波公告! 8800GT 512 贊助卡 會員價NT1500. 限量十張. (http://www.pcdvd.com.tw/showthread.php?t=816181)

http://dcstat.com/sig/3374.gif
http://folding.extremeoverclocking.com/sigs/sigimage.php/un=RazielHCC/t=69220/

jazzblue
2008-09-20, 12:18 AM
雖然是利用CPU閒置時間跑程式,但目前多核心CPU 在閒置時
會進入省電模式 !
若跑那個蛋白質程式,CPU一直持續RUN就會不斷在耗電 !
可能跑這個程式每個月會多繳幾塊錢的電費